一、需求分析
客戶需求:可提供蛋白序列,希望得到純度85%左右的500μg蛋白,蛋白后續(xù)用于酶活實驗,項目預算有限,后期可能需要大量蛋白。
需求分析
如項目預算有限,建議優(yōu)先選擇原核表達系統(tǒng),成本較為低廉,如后續(xù)需要進行大體積放大,可直接進行發(fā)酵,工藝成本更低;對于酶的表達,普健的大腸桿菌表達系統(tǒng)在已往項目中有較為積極的客戶反饋; 基于以上分析,普健建議該項目選用大腸桿菌表達系統(tǒng)。
二、蛋白性質分析
將蛋白序列在蛋白數(shù)據(jù)庫Uniport中比對,一致性較高為80.9%,用生物信息學工具進行蛋白性質分析。
跨膜結構域預測:
信號肽預測:
疏水性預測:
蛋白性質總結:客戶提供蛋白序列一共234 AAs,蛋白大小為25.39 KDa,pI為8.80,疏水性一般,無跨膜結 構域,無信號肽,無糖基化及二硫鍵修飾。
三、實驗設計
綜合蛋白性質及客戶需求分析,設計蛋白表達方案如下:選擇大腸桿菌表達系統(tǒng),表達目的蛋白全長,N端融合6*His標簽,表達載體為pET28b,選用BL21(DE3)、T7E為表達菌株,設置多個誘導溫度及誘導時間,根據(jù)表達測試結果,選擇最優(yōu)條件進行200mL放大,收集樣品采用Ni柱純化,交付蛋白樣品。
四、實驗方法及實驗結果
1、表達載體構建
利用生物信息學工具對目的蛋白全長片段進行密碼子優(yōu)化,降低稀有密碼子水平,用化學合成方法獲得目的蛋白基因序列片段,將片段亞克隆到pET28b表達載體,進行雙酶切驗證及測序確認。進行雙酶切驗證及測序確認。
測序結果:
雙酶切驗證結果:
結果分析:NdeI/XhoI雙酶切測試結果顯示片段大小正確,測序結果顯示序列一致,確認蛋白表達載體構建成功。
2、表達測試
將表達載體轉化至BL21(DE3)菌株、T7E菌株,挑取陽性克隆轉移到含Kana抗性的LB培養(yǎng)基上,37℃培養(yǎng)3-4h,加入1mM IPTG誘導表達,一組37℃培養(yǎng)4h,另一組16℃培養(yǎng)16h過夜,收集蛋白樣品進行SDS-PAGE檢測。
SDS-PAGE結果:
結果分析:根據(jù)SDS-PAGE結果,蛋白大小在25KD左右,與預測蛋白大小相符,比較各條件下蛋白表達情況,確認該蛋白最優(yōu)的表達條件如下:
菌株 | 溫度 | 誘導時間 |
T7E 菌株 | 37℃ | 4h |
3、放大純化
按照得到的最優(yōu)表達條件,轉化200mL大腸桿菌,37℃培養(yǎng)3-4h,1mM IPTG誘導后,37℃培養(yǎng)4h,收集蛋白樣品,用Ni柱進行蛋白純化,得到最終蛋白樣品。
4、QC檢測
將最終得到的蛋白樣品進行濃度測定、SDS-PAGE檢測及His標簽抗體的WB檢測。
SDS-PAGE檢測及WB檢測結果:
結果分析:SDS-PAGE結果顯示蛋白大小在25KD左右,且蛋白純度較好,約為95%; His標簽抗體的WB檢測結果顯示25KD左右曝出條帶,與目的蛋白預測大小相符。
五、交付材料
序號 | 樣品 | 濃度 | 分裝 | 緩沖液 | 管數(shù) |
1 | 蛋白 | 1.00mg/ml | 1.50ml/管 | PBS pH7.5 | 2管 |
2 | 表達載體 | 100ng/ul | 15ul/管 | TE | 1管 |
3 | 表達菌株 | / | 1.00ml/管 | / | 1管 |
合計管數(shù): | 4管 |
六、項目結題
從基因合成到交付蛋白樣品,項目為期5周,得到3.00mg目的蛋白樣品,由于酶活測試的多樣性與特殊性,交付給客戶進行驗收及酶活測試,客戶驗證蛋白大小純度均與QC結果一致,酶活實驗結果表明蛋白有生物活性,綜上,項目順利結題。
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